Vous pouvez rencontrer un problème avec Zend Optimizer et le ionCube Loader (cf. /var/log/apache2/error.log):

PHP Fatal error:  [ionCube Loader] The Loader must appear as the first entry in the php.ini file in Unknown on line 0

C’est très simple à corriger :
On va tout d’abord dans /etc/php5/conf.d/ioncube-loader.ini et on commente l’intégralité des lignes présentes

On va ensuite dans le fichier /etc/php5/apache2/php.ini, on l’on va copier l’intégralité du contenu du fichier ioncube-loader.ini après la balise [Zend], de cette manière :

[Zend]
zend_extension=/usr/lib/php5/ioncube_loader_lin_5.2.so

On redémarre apache et c’est fini